如何促进纸质图书与电子图书的融合是目前日本业界关注的一个热点。2004年日本电子图书市场的规模为45亿日元，2005年为94亿日元，是前一年度的209%倍，2006年则增长到182亿日元。对电子图书需求的增加是人们阅读习惯发生变化的结果。但在一个可以预见的时期内，电子图书也不可能取代纸质图书。对日本出版业来说，尚没有在纸质图书与电子图书之间的相互转换方面找到合适的路径，如何在图书的编辑、包装和销售等层面上打通电子图书和纸质图书的屏障，是出版业界所急需解决的课题。
一个较为人们所认同的方案是在传统的纸质出版物中附加ID，读者通过ID可以获取电子版（网络版）等资源，可采取免费和收费等方式。该模式在数据的制作、流通和销售等过程中可促进纸质、图书和电子图书的融合。此外，这种模式也使得新版图书和二手书具有不同的价值，从而促进新版图书的销售。
其次，手机出版已成为行之有效的赢利模式。对于日本电子出版图书市场的发展来说，另一个制约性的因素就是出版格式的不一致。不同的出版社都以各自不同的文件格式出版图书，电子阅读器的运营环境也不同。不同格式对出版市场的割据成为日本电子图书产业发展的一大瓶颈。
电子图书的发展所面临的瓶颈为手机出版兴起带来了契机，因为日本手机的格式相对统一，加之手机拥有广泛的用户，因而手机出版便勃然兴起。此外，日本政府十分重视手机上网市场的发展，这是日本能较早于2001年引进3G手机技术的主要原因。在政府的推动下，通讯公司在利用频率时不需要支付任何费用。与之相比，当英国和德国分别于2000年和2001年引进3G手机时，政府向通讯公司征收了巨额的许可费。
日本于2003年导入了包月套餐式的定价计费制，手机不再按照流量收费。这直接引发了手机出版热潮。到2006年，日本通过手机上网的人数开始超过通过电脑上网的人数。
以往的电子图书主要是通过个人电脑或专用终端来阅读，一直没有能够形成具有规模的赢利商业模式。但手机小说的出现使得电子书籍得以进入手机出版市场。手机出版也给日本出版业带来了生机。
自2002年以来，手机小说开始逐渐成为一种崭新的出版形态，盈利模式也开始形成。作者把在手机上完成的作品，以短信的形式陆续发到手机小说网站，读者通过手机下载这些小说。到2007年，手机小说大为流行，在东贩发表的畅销书（文艺类）排行榜中，前三位均为手机小说，在前10位中有5部是手机小说。
再次，电子杂志呈现多媒体化倾向。在互联网出现以后，人们获取信息的途径和方式发生了变化，杂志开始为人们所疏远，2008年，在日本出版业界发生的一大现象是许多知名杂志的停刊。为了挽回杂志的颓势，出版业界试图在电子杂志的经营模式方面开拓新的领域。2006年，小学馆和主妇之友社相继推出了电子杂志。小学馆首批推出了《Sook》等3种杂志的电子版。主妇之友社不再出版时尚杂志《ef》的纸质版，拥有22年历史的老牌杂志从此与纸质杂志无缘。
在小学馆和主妇之友社之外，富士山杂志服务公司所开展的业务也别具新意。从2006年秋开始，该公司开始经营一种新型的电子杂志发行业务。希望通过该公司发行杂志的电子版的出版社只需要交付杂志的PDF，然后支付一定数量的发行手续、网页制作费和传输费即可。读者订阅电子杂志时，在下载该公司的软件后，便可以在新杂志发行的当天，从网上下载杂志的最新版。读者可以在电脑上像翻阅纸质杂志一样翻阅电子杂志。经过重新设计的杂志版面具有网络连接和放大和缩小版面的功能，也可以在上面打批注，还可以检索关键词和播放画面。
总的来说，新媒体从根本上颠覆了以往的作者、读者和出版社的概念。以往人们在获取知识内容时会一同购买作为图书载体的材料和包装，如今人们则更倾向于只在网络上下载其所需要的数字化的内容；人们用手机写作、在手机上阅读，新的作者、读者关系得以形成；网上书店正在取代的似乎不仅是实在的书店，它开始具备越来越多的出版社的职能……在网络时代，以往的出版产业经营模式正逐渐失去其有效性，对出版内容的编辑、包装、流通等各个环节都需要重新定位，出版产业正普遍处在一转型时期。尽管在各国间存在技术和制度等方面的差异，及时参照同行业的创新成果无疑会促进出版产业的及早转型。
