按疫情传播情况应将空调通风系统划分为三类，并采取不同的预防控制策略。
第一类为无“非典”病案发生的建筑物集中空调通风系统，应最大限度地利用自然通风，在运行过程中应采取强制性的定期清洗和消毒措施。
第二类为已发生了“非典”病案的建筑物集中空调通风系统，必须进行全面、严格、彻底的消毒，并经疾病预防控制部门检查认可后才可重新投入使用。在运行过程中应采取强制性的定期清洗和消毒措施。
第三类为医院内的空调通风系统，必须采取严格可靠措施，避免交叉感染与防止致病微生物扩散污染，否则一律禁止使用。
空调系统在运行前，必须进行全面清洗和消毒。必须定期清洗、更换空调机组内的过滤器与进回风过滤网：在疫情流行期间应保证每周至少清洗（或更换）一次，疫情过后每月至少清洗（或更换）一次。
对空调通风系统的消毒杀菌必须在新风口和排风口关闭的条件下，熏蒸消毒至少6小时，然后打开新风口、排风口，再运行至少6小时。
收治“非典”病人的医院，凡是带有回风或绝热加湿装置的空调通风系统应暂停使用；隔离病房区（含临时隔离区）不得与普通病房区合用一个空调通风系统。（《北京晨报》2003.5.1）
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